问题描述
我是Linux和R的新手。
我在Ubuntu 11.04中安装了R 2.12。今天我尝试安装一个新包，所以我运行了以下命令：
install.packages('XML')
但安装失败并提供以下信息：
* installing *source* package ‘XML’ ...
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables...
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
No ability to remove finalizers on externalptr objects in this verison of R
checking for sed... /bin/sed
checking for pkg-config... /usr/bin/pkg-config
checking for xml2-config... no
Cannot find xml2-config
ERROR: configuration failed for package ‘XML’
* removing ‘/home/spirit/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.12/XML’
The downloaded packages are in
‘/tmp/RtmpoZYxnv/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("XML") :
installation of package 'XML' had non-zero exit status
我也尝试过：
sudo install.packages('XML')
但它提供了相同的错误信息。
任何人都可以给我任何建议吗？提前致谢。
最佳解决思路
install.packages方法
你需要在shell提示符下安装ubuntu软件包libxml2-dev：
sudo apt-get update
sudo apt-get install libxml2-dev
您需要特殊的sudo功能。
Ubuntu包方法
正如Richie和Dirk所提到的，你也可以使用：
sudo apt-get install r-cran-xml
如果你走这条路，我建议你看一下R ubuntu sources页面，它确保你有一个当前版本的R和相关的R包。如果您使用的是UTSntu的LTS版本，这可能很重要。
次佳解决思路
科林的答案在狭义上是正确的，但同时你可以说是错误的
sudo apt-get install r-cran-xml
因为XML是Ubuntu中可用的CRAN包之一。 apt-cache search r-cran-*会看到其他人。