问题描述
我厌倦了尝试为phyton 2.7.5安装numpy和scipy，我需要这个版本的python，因为我的最终目标是安装类(http://class-code.net/)和montepython(http://montepython.net/)。
(我有ubuntu 12.04)
当我尝试导入numpy或scipy时，我每次都会收到以下错误：
$ phyton2.7
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString
>> import scipy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
from numpy import show_config as show_numpy_config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString
为了摆脱我曾尝试过的错误：
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满足python要求：
$ sudo apt-get install build-essential python-dev gfortran -
使用apt-get安装：
$ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose -
使用pip安装要求：
$ sudo pip install requests -
…并尝试使用pip进行安装：
$ sudo pip install numpy和$ sudo pip install scipy -
我已经有环境var：
export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/dist-packages:${PYTHONPATH}我最后一次安装numpy和scipy(在较旧的ubuntu版本10.x中)这对我有用。 -
sudo sh -c "wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py -O- | python"sudo sh -c "wget https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py -O- | python"然后按照(4)中的pip安装它们但现在看来python-distribute.org的服务器已关闭。我收到以下错误：
http://python-distribute.org/distribute_setup.py Resolving python-distribute.org (python-distribute.org)... failed: Name or service not known. wget: unable to resolve host address `python-distribute.org' -
我还尝试从synaptic和Ubuntu软件中心安装numpy和scipy
我在每次尝试中都失败了，现在我不知道该怎么办。我错过了什么吗？如何为python正确安装numpy和scipy？任何想法将不胜感激。
当我做
echo $PYTHONPATH
我明白了
/usr/lib/python2.7/dist-packages
最佳解决方案
好的，让我们按照installation guide：
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它说你需要python 2.7(你已经拥有)：
$ python --version Python 2.7.4 -
然后它说你也需要numpy包，版本> = 1.4.1：
apt-cache policy python-numpy python-numpy: Installed: (none) Candidate: 1:1.7.1-1ubuntu1 Version table: 1:1.7.1-1ubuntu1 0 500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring/main amd64 Packages如您所见，我有numpy版本1.7.1，所以让我们继续安装它：
sudo apt-get install python-numpy -
现在它说我们需要cython，让我们检查一下这个包是否可用：
apt-cache policy cython cython: Installed: (none) Candidate: 0.17.4-0ubuntu1 Version table: 0.17.4-0ubuntu1 0 500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring/main amd64 Packages我们有它，我们安装它：
sudo apt-get install cython请注意，还有其他正在安装的依赖包。
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奇怪的是，我们也需要scipy模块：
sudo apt-get install python-scipy -
测试。在终端中打开python并输入以下内容：
$ python Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) [GCC 4.7.3] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> import numpy >>> import scipy >>> import cython >>> exit()以上，必须没有错误。如果出现问题，请再次阅读指南，忘记/滑了一步。
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从页面下载CLASS源代码，转到终端中的目录，然后解压缩并进行以下操作：
cd where/the/tar/is tar zxf class_v2.0.2.tar.gz cd class_v2.0.2 make在这里，我们将等到完成。完成后，我们转到python目录并启动魔术。没有从目录移动运行：
cd python python setup.py build python setup.py install --user现在我们在用户目录中安装了CLASS。我们应该测试一下！
python Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) [GCC 4.7.3] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> from classy import Class >>> exit()在这里，一切都很好。
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现在真相时，在你的代码目录中下载monthypython tarball：cd~mkdir code cd code wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1.2.5 .tar.bz2 tar jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2在安装说明are some notes中与此特殊情况(新安装)无关，但在更新montepython时可能很重要。
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这种变化很重要。你还记得你安装CLASS的地方吗？现在你应该告诉Monte Python在哪里。在我的情况下它是
/home/braiam/src/class_v2.0.2/class，你的可能会有所不同。您可以使用find来查找它：find ~ -name class -print那么，现在我使用您喜欢的任何内容修改
default.conf文件(我将使用nano)并修改root路径，因此完整的文件将如下所示：# Fill in the relevant path to your personal distribution. # If you create a new file out of this one, please remember to call # MontePython.py with the option '-conf my.conf' # At minimum, this file should contain one line: # ** path['cosmo'] = path to the cosmological code you are using. Note, if you are # using a modified version of class, be sure that the path contains the word # class, otherwise the code might not recognise it. # If you want to use a data folder different from the one present in the folder # you are executing the code, please also add: # ** path['data'] = /path/to/the/other/data/ root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/' path['cosmo'] = root+'/class/'保存文件并退出。
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测试montepython！如果一切正常，你应该能够在你的montepythong目录中运行
code/MontePython.py --help并运行一切：〜/src /montepython $ code /MontePython.py –help用法：MontePython.py [-h] [-N步数] [-o output folder] [-p input param file] [-c input cov matrix] [-j jump method] [-f jumping factor] [-conf configuration file] [-chain_number chain number] [-r restart from链[]从最佳拟合文件重新启动] [-info [所需文件的计算信息[所需文件的计算信息…]]] [ – 所需的箱数，默认为20] [-no_mean] [ – comp比较文件夹] [-extra plot file for custom needs] [-noplot] [-all] [-ext change extension for output file] [-fontsize desired fontsize，默认为15] [-ticksize desired ticksize，默认为13 ] Monte Py thon，Python中的蒙特卡罗代码可选参数：-h， – help显示此帮助消息并退出-N步数-o输出文件夹-p输入参数文件-c输入cov矩阵-j跳转方法-f跳跃因子-conf配置文件-chain_number链号-r从链-bf重启从最佳拟合文件-info [所需文件的计算信息[所需文件的计算信息…]] – 所需的箱数，默认为20 – no_mean -comp比较文件夹-extra用于自定义需求的绘图文件-noplot -all -ext更改输出文件的扩展名-fontsize desired fontsize，默认为15 -ticksize所需的ticksize，默认为13
有了这个，你已经安装了montepython并准备好了！